تعیین اولویت های پژوهشی در حوزه آموزش نیازمند نیاز سنجی و به تبع آن برنامه ریزی استراتژیک میان مدت و طولانی مدت است. این مهم در دستور کار معاونت آموزشی و مرکز مطالعات و توسعه آموزش پزشکی قرار دارد اما با توجه به ضرورت فعالیت های کوتاه مدت مبتنی بر اهداف این حوزه، ‌تا حصول نتایج معتبر از نیازسنجی های مربوطه؛ سیاست تبعیت از اولویت های پژوهشی کشوری که آن هم متأثر از اولویت های پژوهش در آموزش برای کشورهای مدیترانه شرقی می باشد، مد نظر قرار می گیرد. این اولویت ها در پروژه مشترک سازمان جهانی بهداشت و دانشگاه علوم پزشکی شیراز[1] مصوب گردیده و مصوبات آن به صمع و نظر اعضای کمیته پژوهش در آموزش رسید. اولی ترین مبحث بر اساس نظرات اساتید (با بهره گیری از طیف امتیازدهی ۱ ]کم اهمیت ترین[ تا 10 ]مهمترین[ اولویت) به شرح جدول زیر انتخاب گردیدند.

محور کلی اولویت های پژوهش موارد فوق است معهذا موضوعات مهم پژوهشی در کمیته پژوهش بطور مرتب مد نظر قرار گرفته و در صورت تطبیق با اهداف و همچنین امکانات مرکز، در ردیف اقدامات پژوهشی خواهد بود.